Η Π.Α.Ε.Α.Κ. έχει συνάψει πρωτόκολλα συνεργασίας με την Θεολογική Ακαδημία του Volyn της Αυτοκέφαλης Ορθοδόξου Εκκλησίας της Ουκρανίας, την Κοινωνική Συνεταιριστική Επιχείρηση «ΝΕΦΕΛΑΙΩΝΑΣ ΚΟΙΝ.Σ.ΕΠ.» και τον Σύλλογο Revivart  της Ρουμανίας, ενώ κατά το τρέχον ακαδημαϊκό έτος πραγματοποιούνται οι κατάλληλες διεργασίες προκειμένου να υπογραφούν πρωτόκολλα συνεργασίας με το Ελληνικό Μεσογειακό Πανεπιστήμιο, το Ελληνικό Ανοικτό Πανεπιστήμιο, την θεολογική σχολή της Ιεράς Αρχιεπισκοπής Αμερικής «Holy Cross, Greek Orthodox School of Theology» με έδρα την Βοστώνη, με το Επικοινωνιακό, Επιμορφωτικό Ίδρυμα της Ιεράς Αρχιεπισκοπής Κρήτης και τον Παγκρήτιο Λαογραφικό Σύλλογο, γεγονός που αποδεικνύει τη δυνατότητα συνεργασίας τόσο στον πρακτικό, όσο και στον καθαρά επιστημονικό τομέα, με φορείς σε τοπικό και διεθνές επίπεδο. Σκοπός των εργασιών είναι η ολοκλήρωση και υπογραφή των πρωτοκόλλων συνεργασίας εντός του τρέχοντος ακαδημαϊκού έτους. Βλ. Διεθνείς Σχέσεις - Συνεργασίες.